Chƣơng 1: MỞ ĐẦU 1

1.1. Đặt vấn đề 1

1.2. Mục đích - yêu cầu 2

1.2.1. Mục đích 2

1.2.2. Yêu cầu 2

1.3 Giới hạn của đề tài 2

Chƣơng 2: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 3

2.1. Một số đặc tính để phát triển kiểng xƣơng rồng 3

2.2. Phân loại thực vật và giới thiệu về cây xƣơng rồng (Cactaceae) 4

2.2.1. Phân loại thực vật 4

2.2.2. Giới thiệu về cây xƣơng rồng và các cây cùng họ 4

2.2.3. Tình hình sản xuất và phát triển xƣơng rồng ở Tp. Hồ Chí Minh và trên thế giới 5

2.2.3.1. Tại Tp. Hồ Chí Minh 5

2.2.3.2. Trên thế giới 6

2.2.4. Đặc tính thực vật và điều kiện sinh thái của xƣơng rồng (theo Huỳnh Văn Thới, 2004) 6

2.2.4.1. Đặc tính thực vật6

2.4.2.2. Điều kiện sinh thái 10

2.2.5. Bệnh hại trên cây xƣơng rồng 11

2.2.5.1. Bệnh thối gốc xƣơng rồng 11

2.2.5.2. Bệnh đốm than 11

2.2.5.3. Tuyến trùng hại xƣơng rồng 12

2.2.5.4. Rệp sáp hại xƣơng rồng 12

2.3. Sự phân loại, phân bố, phạm vi kí chủ, đặc điểm phát sinh phát triển và khả năng gây bệnh của nấm Fusarium 12

2.3.1. Sự phân loại 12

2.3.2. Sự phân bố 14

2.3.3. Phạm vi kí chủ 14

2.3.4. Đặc điểm phát sinh phát triển của nấm Fusarium 14

2.4. Khả năng gây hại của nấm Fusarium spp. gây ra và biện pháp phòng trừ 14

2.4.1. Khả năng gây hại 14

2.4.2. Một số biện pháp chủ yếu để phòng trị nấm Fusarium spp. 16

2.4.2.1. Sử dụng cây giống kháng bệnh 16

2.4.2.2. Biện pháp canh tác 16

2.4.2.3. Biện pháp hóa học 17

2.5. Tổng quan về vùng tef trên genome của nấm Fusarium 17

2.6. Ứng dụng kỹ thuật PCR trong phát hiện nấm 18

2.6.1. Khái niệm 18

2.6.2. Nguyên tắc 19

2.6.3. Các yếu tố ảnh hƣởng đến kết quả phản ứng PCR 20

2.6.4. Ứng dụng của PCR 22

2.7. Giới thiệu sơ lƣợc về kỹ thuật DNA sequencing 22

2.8. Một số nghiên cứu trong và ngoài nƣớc về bệnh do nấm Fusarium spp. 22

2.8.1. Trên thế giới 22

2.8.2. Tại Việt Nam 25

2.9. Danh mục một số loài Fusarium đƣợc tìm thấy ở Việt nam 26

Chƣơng 3: VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 27

3.1. Vật liệu thí nghiệm 27

3.1.1. Thời gian – địa điểm nghiên cứu 27

3.1.2. Vật liệu 27

3.2. Phƣơng pháp nghiên cứu 29

3.2.1 Điều tra tình hình bệnh chết trên cây xƣơng rồng tại TP. Hồ Chí Minh29

3.2.2. Phân lập mẫu nấm 29

3.2.3. Tăng sinh khối nấm trên môi trƣờng nhân sinh khối 31

3.2.4. Ly trích DNA tổng số của nấm 32

Quy trình này đƣợc thực hiện dựa trên quy trình của Lee và Taylor. 32

3.2.5. Điện di xem DNA tổng số 32

3.2.6. Thực hiện phản ứng PCR khuếch đại vùng tef các dòng nấm Fusarium spp. 33

3.2.7. Đọc trình tự sản phẩm PCR 35

3.2.8. Chủng nấm lên cây xƣơng rồng 36

3.2.8.1. Tiến hành chủng bệnh trên xƣơng rồng36

3.2.8.2. Đánh giá kết quả 36

Chƣơng 4: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 37

4.1. Tình hình bệnh hại xƣơng rồng tại Tp. Hồ Chí Minh 37

4.2. Các triệu chứng bệnh trên xƣơng rồng 37

4.2.1. Tỷ lệ nhiễm bệnh do vi khuẩn, nấm, virus gây ra qua các vƣờn điều

tra (số liệu điều tra tháng 04 năm 2007). 39

4.3. Phân lập mẫu nấm 40

4.4. Kết quả ly trích thu DNA tổng số từ các loài nấm Fusarium spp. 41

4.5. Kết quả phản ứng PCR khuếch đại vùng tef 43

4.6. Kết quả giải trình tự vùng tef 43

4.7. Chủng bệnh trên xƣơng rồng 50

Chƣơng 5: KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 52

5.1. Kết luận 52

5.2. Đề nghị 53