Về việc phân công quản lí đối tượng nộp thuế giữa Cục Thuế và Chi cục Thuế thực hiện theo công văn 3669 TCT/TCCB ngày 23/10/1998 và công văn 4430 TCT/TCCB ngày 27/11/1999 của Tổng cục Thuế.

- Việc quản lí các khoản thu ngân sách gồm: Lệ phí trước bạ nhà đất ( đối với trường hợp UBND huyện đăng kí và cấp giấy chứng nhận), Tiền sử dụng đất, Thuế chuyển quyền sử dụng đất (đối với trường hợp UBND quận, huyện cấp đất và công nhận chuyển quyền ), các loại phí, lệ phí do các cơ quan, tổ chức cấp huyện ( quận, thị xã, thành phố thuộc tỉnh) quản lí thu, được phân công như sau:

+ Đối với Chi cục Thuế thị xã, thành phố thuộc tỉnh; quận; huyện đồng bằng trung du và các Chi cục Thuế không thuộc quy định tại điểm 2 Thông tư 116/1999/TT/BTC: các khoản thu nói trên giao cho Tổ Nghiệp vụ quản lí thu.

+ Đối với Chi cục Thuế huyện miền núi, tây nguyên, hải đảo, vùng sâu, vùng xa có số thu ít, biên chế cán bộ dưới 30 người: các khoản thu nói trên giao cho Tổ Kế hoạch , nghiệp vụ, tính thuế, kế toán thu và quản lí ấn chỉ thu.

+ Đối với Chi cục Thuế các quận thuộc thành phố, Chi cục Thuế thành phố thuộc tỉnh, nếu các khoản thu nói trên diễn ra thường xuyên và có số thu lớn, thì Cục Thuế có thể xem xét Đội quản lí thu lệ phí trước bạ và thu khác để quản lí thu các khoản thu nói trên.

Đối với nhà, đất do UBND tỉnh, thành phố tổ chức đăng kí và cấp giấy chứng nhận; nhà, đất các quận nội thành phố, thị xã nơi tỉnh, thành phố đóng trụ sở thì lệ phí trước bạ do Phòng Thu lệ phí trước bạ và thu khác của Cục Thuế quản lí thu.

Tổ nghiệp vụ (hoặc Đội quản lí thu lệ phí trước bạ và thu khác ) cần phải phối hợp với các Đội Thuế xã, phường, thị trấn trong việc kiểm tra, xác minh các hồ sơ, tờ khai thuế, lệ phí, đảm bảo tính chính xác để chuyển cho Tổ Kế hoạch, tính thuế, lập bộ thuế và kế toán thu thực hiện tính thuế, ra thông báo thu, đảm bảo sự kiểm tra giám sát lẫn nhau trong quá trình quản lí các khoản thu nói trên.