Viện Khoa học Tài chính có nhiệm vụ tổ chức công tác nghiên cứu khoa học về kinh tế, tài chính, quản lý công tác nghiên cứu khoa học trong toàn ngành, thực hiện các dịch vụ nghiên cứu khoa học, chuyển giao và ứng dụng kết quả nghiên cứu khoa học về kinh tế, tài chính; tham gia các công tác đào tạo, bồi dưỡng, hợp tác quốc tế và các hoạt động khác theo quy định của Giám đốc Học viện Tài chính.

Nghiên cứu lý luận cơ bản tài chính. tiền tệ, chính sách tài chính, tiền tệ, thị trường tài chính, tiền tệ trong nước và quốc tế.

Tham mưu cho lãnh đạo Bộ Tài chính trong việc hoạch định các chính sách tài chính và cơ chế quản lý tài chính ngắn hạn, trung hạn và dài hạn.

Tổ chức điều tra, thống kê và phân tích, đánh giá, dự báo tình hình kinh tế, tài chính, tiền tệ.

Xây dựng hệ thống dữ liệu, cung cấp thông tin kinh tế - tài chính trong và ngoài nước, biên soạn,xuất bản các ấn phẩm dùng làm tài liệu tham khảo dưới hình thức “Thông tin chuyên đề”.