Sở Kế hoạch và Đầu tư Hà Nội được thành lập theo quyết định số 2743/QĐ-UB ngày 23 tháng 8 năm 1996 của UBND Thành phố Hà Nội trên cơ sở tổ chức và sắp xếp lại Uỷ ban Kế hoạch và nhiệm vụ đầu tư, hợp tác viện trợ kinh tế của Sở Kinh tế đối ngoại chuyển sang.

Sở Kế hoạch và Đầu tư Hà Nội là cơ quan chuyên môn của UBND Thành phố Hà Nội, chịu sự lãnh đạo, chỉ đạo trực tiếp của Thành Uỷ, UBND Thành phố; là cơ quan tham mưu tổng hợp về quy hoạch, kế hoạch phát triển kinh tế x• hội của Thành phố, dưới sự chỉ đạo về chuyên môn nghiệp vụ của Bộ Kế hoạch và Đầu tư.