Công ty vận tải số 3 được thành lập tháng 3 năm 1983 kế thừa và phát huy truyền thống của 3 xí nghiệp vận tải hàng hoá. Xí nghiệp vận tải ô tô số 2, xí nghiệp vận tải ô tô số 20, xí nghiệp vận tải quá cảnh C1 và chi cục Đại lý vận tải số 8. Tất cả đều là những đơn vị có bề dày truyền thống và rất đáng tự hào gắn liền với lịch sử 50 năm trưởng thành của ngành vận tải ô tô Việt Nam.

Những cái tên như đoàn xe 105, quốc doanh ô tô trung ương gắn liền với những chiến dịch Tây Bắc năm 1952, chiến dịch Thu Đông năm 1953 … tiến tới chiến thắng lịch sử Điện Biên Phủ chấn động địa cầu 1954, kết thúc cuộc kháng chiến chống Pháp thần thánh của dân tộc ta.

Hoà bình lập lại cùng vớ sự phát triển của toàn ngành, các đơn vị vận tải ô tô cũng trưởng thành nhanh chóng trong hoà bình và xây dựng miền bắc XHCN.

Ngày 5 - 8 - 1964 đế quốc Mỹ leo thang đánh phá miền Bắc. Vận tải ô tô bước vào thời kỳ khó khăn, gian khổ và ác liệt nhất. Song cũng để lại dấu ấn lịch sử sáng chói trong cuộc kháng chiến chống Mỹ cứu nước thần thánh của dân tộc. Ngay từ những ngày đầu của cuộc chiến tranh phá hoại các đoàn xe của Công ty đã có mặt ở tuyến lửa khu 4, chiến dịch đường 9 Nam - Lào, mặt trận Quảng Trị làm nhiệm vụ vận chuyển vũ khí, đạn dược, hàng hoá … Góp phần chia lửa với tiền tuyến lớn, chi viện cho chiến trường miền Nam và thực hiện nghĩa vụ quốc tế cao cả. Có thể nói vận tải ô tô đã chiến thắng cuộc chiến tranh phá hoại của đế quốc Mỹ xâm lược. Trong cuộc kháng chiến đó những chiến công vang dội của các đoàn xe vận tải đã góp phần lập nên thắng lợi của tổng tiến công nổi dậy mùa xuân 1968, năm 1972 và chiến dịch Hồ Chí Minh đại thắng 1975, giải phóng miền Nam thống nhất đất nước. Trong cuộc chiến tranh gian khổ và hào hùng của dân tộc nhiều tấm gương chói sáng của các chiến sĩ lái xe dũng cảm của người, cứu xe vượt qua mưa bom, bão đạn đưa từng tấn hàng tới đích an toàn. Tiêu biểu là 38 cán bộ công nhân viên của Công ty đã anh dũng hy sinh, hàng trăm đồng chí là thương binh. Với những công lao đóng góp to lớn của các tập thể, cá nhân trong suốt thời kỳ kháng chiến chống Mỹ cứu nước. Năm 1967 tập thể đội xe 202 được Nhà nước phong tặng đơn vị anh hùng đầu tiên của ngành vận tải ô tô trong cuộc kháng chiến chống Mỹ cứu nước. Được Bác Hồ tặng cờ luân lưu, được Nhà nước tặng thưởng huân chương chiến công và Nhà nước dân chủ nhân dân Lào tặng thưởng 1 huân chương tự do hạng nhất, một huân chương tự do hạng nhì và 162 huân, huy chương các loại cho cán bộ công nhân viên của Công ty đã có nhiều đóng góp cho sự nghiệp cách mạng của nhân dân Lào. Tổng kết thời kỳ chống Mỹ cứu nước cán bộ công nhân viên Công ty được Nhà nước trao tặng 969 huân chương, huy chương các loại.