Tin sinh học ngày nay đóng góp một phần quan trọng vào những nghiên cứu sinh học của con người. Trong đó, bài toán bắt cặp trình tự là cơ sở cho rất nhiều bài toán tin sinh học khác như: dự đoán cấu trúc protein, chú giải gen, … Với sự gia tăng của kích thước dữ liệu trong ngân hàng gen, việc bắt cặp trình tự trở nên hết sức phức tạp.

Hiện nay, công nghệ tính toán trên GPU đã trở nên phát triển. Điều này đã mở ra một hướng đi mới cho các bài toán tin sinh học được giải quyết trên môi trường tính toán GPU. Cùng với đó, hệ thống tính toán phân cụm GPU (GPU Cluster) cũng được ra đời để tận dụng sức mạnh tính toán của cạc đồ họa. Vì vậy trong đề tài này, em đưa ra giải pháp triển khai bài toán bắt cặp trình tự trên hệ thống GPU Cluster.

Kết cấu đề tài:

Chương 1. Giới thiệu chung

Chương 2. Tin sinh học và bài toán bắt cặp trình tự

Chương 3. GPU và công nghệ tính toán đa dụng trên GPU

Chương 4. Triển khai bắt cặp trình tự trên hệ thống GPU CLUSTER

Chương 5. Kết luận và hướng phát triển