Đề án Quy hoạch mạng lưới các trường đại học, cao đẳng giai đoạn 2006 – 2020 đã được xây dựng cách đây hơn 2 năm. Đây là 1 đề án lớn, có vai trò rất quan trọng trong việc định hướng phát triển hệ thống giáo dục đại học nước ta. Tuy nhiên sau khi được Thủ tướng Chính phủ phê duyệt đến nay đề án vẫn chỉ nằm trên giấy và chưa đạt được các hiệu quả mong muốn như:

- Giúp sinh viên có thể sử dụng tối đa lợi thế của từng trường

- Nâng cao chất lượng và hiệu quả đào tạo đại học

- Tăng cường cơ sở vật chất kỹ thuật trang bị cho các trường

- Bảo đảm sự thích ứng giữa các cơ sở đào tạo với yêu cầu phát triển kinh tế - xã hội của mỗi địa phương và của cả nước

- Thể hiện được những yêu cầu phát triển bên trong của bản thân hệ thống giáo dục đại học

- Nâng cao quyền tự chủ và tăng cường tính tự chịu trách nhiệm trước xã hội của mỗi trường

- Đáp ứng yêu cầu về phân cấp trong lĩnh vực quản lý đại học

Những bất cập chính của đề án còn thể hiện ở các mặt:

- Đề án chưa cho chúng ta 1 cái nhìn đầy đủ về hệ thống giáo dục đại học cả về những mặt được, chưa được và nguyên nhân tạo nên hiện trạng đó

- Nội dung quy hoạch của đề án đã đưa ra cái nhìn cụ thể nhưng 1 vài tiêu chí không hợp lý, chỉ tiêu không khả thi, nặng về mặt số lượng mà chưa chú trọng đến chất lượng đầu ra

Ngoài lời mở đầu và các phụ lục và bản đồ quy hoạch, đề án được kết cấu gồm 3 phần:

Phần thứ nhất: Thực trạng mạng lưới và quy hoạch mạng lưới các trường đại học, cao đẳng

Phần thứ hai: Qui hoạch mạng lưới các trường đại học, cao đẳng giai đoạn 2006 – 2020

Phần thứ ba: Điều kiện, giải pháp và bước đi thực hiện qui hoạch mạng lưới trường đại học, cao đẳng giai đoạn 2006 – 2020