Trong những năm qua, công tác cải cách Hành chính của Kiểm toán Nhà nước (KTNN) luôn được quan tâm chỉ đạo và thực hiện thường xuyên nhằm Xây dựng KTNN vững mạnh, chính quy và từng bước hiện đại; Xây dựng đội ngũ cán bộ, Công chức có đủ phẩm chất đạo đức, năng lực chuyên môn; hệ thống các đơn vị trực thuộc KTNN hoạt động có hiệulực, hiệu quả, đáp ứng yêu cầu kiểm tra, kiểm soát, giám sát của Nhà nước trong quản lý, sử dụng ngân sách, tiền và tài sản nhà nước.

Ngay sau khi Luật KTNN có hiệu lực thi hành, toàn ngành KTNN đã tập trung nhân lực và thời gian Xây dựng các Văn bản hướng dẫn Luật, đồng thời lập kế hoạch cụ thể để hoàn thiện đông bộ các quy trình kiểm toán; các quy định liên quan đến tổ chức và hoạt động kiểm toán; các Quy chế làm việc của KTNN cũng như của từng đơn vị trực thuộc; quy định rõ chức năng, nhiệm vụ và gắn với phân công, phân cấp, phân nhiệm cụ thể. Quá trình thực hiện Quy chế làm việc của KTNN, Quy chế tổ chức và hoạt động của Đoàn kiểm toán, Quy định về trình tự lập, thẩm định, xét duyệt và gửi báo cáo kiểm toán…đã tạo những chuyển biến trong các mặt hoạt động nói chung và công tác kiểm toán nói riêng; bước đầu đã nâng cao chất lượng kiểm toán gắn với việc đẩy nhanh tiến độ kiểm toán trên cơ sở đẩy mạnh các giải pháp cải cách Hành chính về mặt thể chế, thủ tục và trình tự xử lý.

Để đảm bảo triển khai đồng bộ, hiệu quả chương trình cải cách Hành chính của KTNN, ngày 29/1/2008 Tổng KTNN đã ban hành kèm theo Quyết định số 01/2008/QĐ-KTNN Chương trình hành động về đẩy mạnh cải cách Hành chính, nâng cao năng lực, hiệu lực và hiệu quả quản lý của KTNN với các nội dung về cải cách thể chế Hành chính, cải cách tổ chức bộ máy Hành chính, thực hiện đổi mới, nâng cao chất lượng cán bộ, Công chức KTNN, cải cách Tài chính công, hiện đại hóa hành chính.

-Về cải cách thể chế Hành chính

-Về công tác cải cách tổ chức bộ máy KTNN

-Về nâng cao chất lượng cán bộ, Công chức KTNN

-Về công tác cải cách Tài chính công

-Về công tác hiện đại hóa nền hành chín